إن تصميم نظام معالجة مياه غسيل الكلى معقد للغاية ويتطلب مراحل متعددة من التنقية لضمان أن جودة المياه تلبي المعايير. وتشمل الخطوات الرئيسية معالجة المياه الخام مسبقًا، ومعالجة التناضح العكسي، وتخزين المياه النقية وتوزيعها، والمراقبة النهائية والتحكم.