عند معالجة المياه المالحة، من المهم اختيار نظام التناضح العكسي المناسب، وخاصة نظام التناضح العكسي القياسي لمياه البحر (سورو) ونظام التناضح العكسي للمياه المالحة (بى دبليو ار او) لهما مزايا واضحة في معالجة مصادر المياه ذات محتويات الملح المختلفة.

إن النقاء العالي لمياه التناضح العكسي يعني أنها تفتقر إلى المعادن الضرورية، وهو أمر غير جيد للأسماك التي تعيش في المياه العذبة. تعتمد الأسماك التي تعيش في المياه العذبة على المعادن الموجودة في الماء للحفاظ على الوظائف الفسيولوجية، مثل الكالسيوم، الذي يلعب دورًا مهمًا في نمو العظام والصحة.

تستخدم محطة المياه القلوية تقنية الترشيح بغشاء التناضح العكسي للحصول على مياه نقية وإضافة كيماويات الأس الهيدروجيني.